در کتاب نفس مطمئنه که تقریری از مباحث عاشورایی استاد میرباقری می باشد سعی شده است تا مباحث استادمیرباقری در قالب و نظمی که نگارنده از مباحث خود ایشان دریافت کرده است، تنظیم شود؛ از این رو در مواردی ممکن است در نظامی که استاد در سخنرانی های خود ارائه کرده اند، تغییراتی رخ داده باشد؛ البته سعی فراوان شده است که این تغییرات موجب خللی در فهم کلمات ایشان نگردد؛ 
مثلا در عنوان «جایگاه امام و فعل امام در نظام خلقت»، یا عنوان «شناخت دشمنان ائمه» که در این کتاب آمده است، استاد مباحث مختلفی را در مجالس مختلفی طرح کرده اند که در اینجا سعی شده آنچه مربوط به تحلیل عاشوراست، آورده شود.

کتاب نفس مطمئنه استاد میر باقری در قطع رقعی و با جلد شومیز در 503 صفحه به چاپ رسیده است.